Program Studi Teater Musikal menyelenggarakan pendidikan yang menerapkan konsep kolaborarif dengan melibatkan tiga kompetensi seni yakni seni drama, tari dan musik. Pembelajarannya diarahkan untuk menghasilkan lulusan Sarjana Terapan teater yang aktif merespon industri seni pertunjukan, mampu menciptakan peluang baru dengan daya kreatifnya, peka terhadap ide-ide baru seni pertunjukan, serta mampu mendistribusikan dan mengkomunikasikan gagasan-gagasan baru seni pertunjukan untuk dunia.
Sebagai salah satu program studi di lingkungan Fakultas Seni pertunjukan ISI Yogyakarta, Program Studi Teater Musikal memiliki keunikan atau keunggulan dalam berkarya seni berbentuk teater maupun film musikal dengan sumber materi artistik kesenian tradisi Nusantara dan modern yang diekspresikan melalui virtuositas vokal, kecerdasan tubuh, dan penghayatan karakter. Virtuositas vokal dibentuk melalui pelatihan dalam tradisi vokal Nusantara dan tradisi vokal Barat. Kecerdasan tubuh dipelajari melalui repertoar-repertoar tari Nusantara. Penghayatan karakter dicapai melalui pelatihan fleksibilitas tubuh, fleksibilitas vokal, pengolahan emosi, dan teknik berperan. Strategi pembelajaran yang mengkombinasikan estetika tradisi dan modern menjadi pola yang ditempuh Prodi Teater Musikal agar lulusannya dapat menghasilkan karya seni yang mampu merespon kebutuhan industri seni pertunjukan dan mendunia tanpa kehilangan akar tradisinya. Dalam lima tahun ke depan, Prodi Teater musikal merancang kegiatan yang bertujuan untuk peningkatan dan penguatan kompetensi lulusan, terutama kemampuan untuk merespon industri seni pertunjukan yang ada. Target capaian akan ditempuh melalui rencana pembelajaran mata kuliah dan aktifitas akademik lainnya seperti studi lapangan industri, magang, proyek independent, pertukaran mahasiswa diharapkan mampu menjadikan Prodi Teater Musikal semakin dikenal dan dibutuhkan dalam industri seni pertunjukan dunia.